เนื้อเรื่องของ Hell Rising จะพา Takechiyo โชกุนตัวเอกของเรื่องข้ามเวลาไปยังเอโดะในอนาคต ซึ่งหลังจากการสิ้นพระชนม์ของ Takechiyo แห่งอนาคต ยุคสันติก็สิ้นสุดลง และ Crucible ได้กลับมายึดครองเอโดะอีกครั้ง กลายเป็นดินแดนที่ Yokai, กบฏมนุษย์ และนักเล่นแร่แปรธาตุจากต่างแดนต่างมุ่งบุกเข้ามา
ในการเผชิญกับภัยคุกคามครั้งใหม่ที่เกี่ยวพันกับ Spirit Stones และศัตรูที่เต็มไปด้วยความเคียดแค้นต่อรัฐบาลโชกุน Takechiyo จะได้ร่วมมือกับ Yagyu Jubei นักดาบตาเดียวผู้โด่งดัง และ Rodrigo ทูตจากสเปน เพื่อฝ่าฟันพล็อตลึกลับในเอโดะยุค Keian ปี 1651 ที่กลายเป็นนรกไปแล้ว
ข้อมูลถือว่าเป็นอาวุธอย่างหนึ่งของเกมเมอร์ ดังนั้นการเสพข่าวก็เหมือนการลับอาวุธตลอดเวลา